L'agriculture biologique dynamique est la première en date des méthodes dites « biologiques ».

Il ne s'agit pas d'une agriculture naturelle au sens d'un retour à la nature mais bien de comprendre les lois de la nature et de les respecter au mieux dans les pratiques agricoles. Ainsi toutes les bonnes pratiques agronomiques communes avec l'agriculture biologique font partie intégrantes de la méthode, comme les soins apportés à l'élaboration des composts, les rotations longues, la culture des légumineuses et des plantes à enracinement profond, le travail modéré du sol, le désherbage mécanique…

La biodynamie, comme l'agriculture biologique, souhaite éviter l'épuisement des sols par une exploitation trop intensive. Ces deux agricultures évitent aussi toutes les deux l'utilisation d'engrais chimiques, mais se distinguent par le but de cet évitement et par la rigueur.

Alors que l'agriculture biologique a pour objectif d'établir une production agricole durable en évitant les produits industriels et minimisant les apports extérieurs, mais en les autorisant sous certaines conditions, la biodynamie affiche une volonté de produire des plantes dites saines en proscrivant l'emploi d'engrais et pesticides solubles, naturels ou non. Seuls les composts de substances végétales ou animales, susceptibles d'être décomposées par les organismes vivants dans le compost sont autorisés. 

Pour la maîtrise des maladies et des ravageurs, l'agriculture bio-dynamique comme l'agriculture biologique peuvent utiliser la technique des plantes compagnes, c'est-à-dire de plantes qui se renforcent mutuellement par leur proximité. De même dans la lutte contre les parasites, elle utilise aussi des infusions, décoctions, purins, ou des préparations de diverses plantes comme l'absinthe, la tanaisie, la phacélie à feuilles de tanaisie, le raifort, la ciboulette, la poudre de racine de fougère, le pyrèthre, le bois de quassia et aussi des substances minérales comme la Chaux en poudre ou la poudre d'algues calcifiées. Certains engrais complémentaires sont accessoirement utilisés, comme la poudre de basalte, la poudre de plume ou de soies de porc.

L'usage de produits auxiliaires ou « préparations » fait principalement la spécificité de l'agriculture bio-dynamique. Ces préparations ont été mises au point à partir d'indications données par Rudolf Steiner.

Il y a six préparations et deux préparations à pulvériser sur les cultures. Quatre d'entre elles servent à dynamiser et vivifier le compost lors de son élaboration. L'une des deux autres est à pulvériser directement sur les sols et la dernière directement sur les plantes pendant la croissance.

Ces six préparations, dénommées en pratique par un numéro allant de 502 à 507, sont élaborées à partir de diverses plantes et joueraient chacune un rôle spécifique :

1. d'achillée millefeuille Achillea millefolium (502) qui jouerait un rôle particulier dans la mobilité du soufre et de la potasse
2. de camomille Matricaria recutita (503), liée au métabolisme du calcium et régularise les processus de l'azote
3. d'ortie Urtica dioïca (504). En rapport avec l'azote et le fer, elle renforcerait l'influence des deux premières préparations en donnant au compost et au sol une « sensibilité » et favorise une bonne humification
4. d'écorce de chêne Quercus robur (505). Pour les bio-dynamistes cette préparation aurait un rapport avec le calcium et régulariserait les maladies des plantes dues à des phénomènes de prolifération, d'exubérance
5. de pissenlit Taraxacum dens leonis (506). Jouerait notamment un rôle au niveau de l'acide silicique
6. de valériane Valeriana officinalis (507). Cette préparation aiderait à la mobilité du phosphore dans les sols

Pour l'achillée, la camomille, le pissenlit et la valériane, la préparation est confectionnée avec les fleurs. Pour l'ortie, on utilise la plante entière avec de jeunes fleurs. Il existe aussi en fait une « préparation » 508 qui est constituée de prêle des champs (Equisetum arvense). Ce n'est pas à vrai dire une préparation car on utilise la décoction de plante fraîche en aspersion ou arrosage pour lutter contre les maladies cryptogamiques et certains parasites.

Ces préparations sont pour la plupart obtenues au travers d'un processus fermentaire dans des organes animaux : vessie, mésentère, intestin et crâne d'animal domestique. Deux grammes de chacune de ces six préparations suffisent pour des volumes allant jusqu'à 10 mètres cube de matière à composter.

 
Deux grandes préparations sont essentielles en agriculture biologique dynamique :

• La première s'appelle la « bouse de corne » ou en pratique 500. Elle est confectionnée à base de bouse de vache de qualité qui est introduite dans une corne puis enterrée durant la période hivernale. La bouse subit un processus de fermentation et se transforme en humus naturel. Elle est conçue pour asperger le sol et les plantes. Cette préparation occupe une place primordiale dans l'agriculture bio-dynamiste car elle s'adresse au sol et aux racines des plantes. Ainsi elle serait un puissant édificateur de la structure du sol en favorisant l'activité microbienne et la formation de l'humus, améliorant ainsi l'absorption racinaire et la rétention d'eau dans le sol.

Les Australiens ont mis au point une préparation composée, dénommée « bouse de corne préparée ou 500P », destinée à être pulvérisée sur les parcelles et qui contient la bouse de corne (500) et les six préparations habituellement destinées au compost (502 à 507). Elle s'utilise après une dynamisation de 20 mn à une dose d'environ 250 g/ha. Le plus connu en France est le Compost de bouse selon Maria Thun (CBMT dénommé aussi MT), et dans la plupart des autres pays Cowpat pit (CPP). L'utilisation de ces préparations est variable selon les écoles biodynamiques;

• La seconde préparation s'appelle la « silice de corne » ou 501. Elle est élaborée à partir de quartz (silice cristallisée) très finement réduit en poudre et passée en terre, durant la période estivale, dans une corne de vache. On l'utilise en pulvérisation sur les plantes durant la période végétative : cette préparation complémentaire de la 500 ne s'adresse pas au sol mais à la partie aérienne des plantes. Considérée par les bio-dynamistes comme une « pulvérisation de lumière » cette préparation apporterait une « qualité lumineuse » aux plantes pouvant selon les cas favoriser la vigueur ou au contraire atténuer une trop grande luxuriance et les tendances aux maladies.

Ces préparations doivent être diluées dans l'eau, généralement de l'eau de pluie récupérée ou de l'eau de source, et brassées pendant exactement une heure en plein air : c'est la dynamisation dans laquelle la formation d'un tourbillon (vortex) suivie d'un chaos énergique sont essentiels. Elles sont ensuite immédiatement pulvérisées pour entrer en contact avec le sol ou les plantes. Les quantités employées sont très faibles : 90 à 120 grammes dans un volume de 30 à 50 litres d'eau par hectare pour la bouse de corne et seulement 4 grammes par hectare pour la silice dans des volumes d'eau comparables.